Filudvidelsesbibliotek


.CRAM filudvidelse

  • Udvikler af: EBI
  • Kategori: Datafiler
  • Format: Binært

Hvad er .CRAM-filer, og hvordan åbner man dem?

Kan du ikke åbne .CRAM-filen? Er du i tvivl om, hvad den indeholder? På vores side vil vi forklare dig, hvad denne fil er, hvad den bruges til, og hvilken software der åbner .CRAM-filen.

Hvad er en .CRAM filtypenavn?

.CRAM filtypenavnet er oprettet af EBI. .CRAM er blevet klassificeret som datafiler. Formatet på .CRAM-filen er binært.

.CRAM er Compressed Alignment File

Komprimeret tilpasningsfilformat udviklet af EBI, en udstationering af European Molecular Biology Laboratory; gemmer korte DNA-sekvens læse alignments genereret fra korte læse aligners såsom BWA, BBMap og BLAT.

CRAM-filformatet ligner filformatet Binary Alignment/Map (BAM), men har bedre filkomprimering og et omstruktureret kolonneorienteret binært containerformat. Efterhånden som datamængderne stiger i det genetiske softwarefelt, blev CRAM-formatet designet til at reducere diskfodaftrykket af justeringsdata.

Short read alignment er processen med at dechifrere, hvor en sekvens kommer fra i genomet. Dette kan være svært, da referencegenomet er ret stort, og man ikke altid leder efter nøjagtige matchninger i referencegenomet. Short read aligners bruges til at søge i enorme sekvenser for matches og near-matches. Da sekvenserne er så store, er komprimering leveret af formater som CRAM nødvendig for at holde filstørrelser håndterbare.

Liste over al software, der kan åbne den komprimerede tilpasningsfil
Windows
Samtools

Sådan løser du problemer med .CRAM-filer

  1. Du skal opdatere det program, som du normalt bruger til at åbne .CRAM-filer. Kun den seneste version af softwaren understøtter det aktuelle .CRAM-filformat
  2. Du skal tjekke .CRAM-filen for virus. For at gøre dette skal du scanne det med et populært antivirus (Norton, Nod32, Kaspersky, Dr.Web osv.)